Postoje neki rizici i nedoumice s li-ionskim baterijama kojih bi svi trebali biti svjesni;
Postoji mala mogućnost da će se zapaliti ako padne na čvrstu površinu velikom brzinom.
Potpuno pražnjenje li-ionske baterije moglo bi je uništiti.
Visoka temperatura je štetna za njegov vijek trajanja. Čuvanje ovih baterija na visokim temperaturama uzrokovalo bi njihovu bržu degradaciju.
Njihova degradacija počinje odmah nakon što se isporuče iz tvornice. Dakle, očekuje se da će većina litijevih baterija trajati samo dvije do tri godine od datuma proizvodnje.
U ovim baterijama nalazi se zapaljivi elektrolit koji može izazvati manje požare baterija. To se vidjelo na Samsungu Note 7, te je uzrokovalo da proizvođači zaustave daljnju proizvodnju i proizvodnju.
Litijske baterije nisu dopuštene u zrakoplovima jer postoji mogućnost da proizvedu bizarne razine topline i mogu dovesti do neugasivog požara. To je razlog zašto su zrakoplovne vlasti zabranile litij-ionske baterije.